Shogun Big Box comprend le jeu de base Shogun, l'extension Tenno's Court 1, l'extension Samurai 2, l'extension Military Leaders 3 et l'extension Chambers 4, ces trois dernières étant exclusives à cette édition.
Avec Samurai, au début de chaque tour, lorsque vous contrôlez des provinces dans au moins quatre régions, vous révélez une meilleure carte et choisissez un bonus parmi ceux qu'elle propose. Pour cette raison, la première carte est de facto inutilisée, et les autres vous fournissent soit de l'or (2, 4, 6), du riz (0, 1, 2), des armées sur le plateau (1, 2, 3) ou des points de victoire (0, 0, 1).
Avec Military Leaders, chaque joueur reçoit une figurine de chef militaire à placer sur l'un des comtés qu'il contrôle. Lorsqu'il effectue des actions dans ce comté, il bénéficie d'avantages supplémentaires, tels que la réduction de 1 du coût des bâtiments ou l'obtention d'un grain supplémentaire. À la fin de son tour, le joueur déplace ensuite le chef vers un comté adjacent sous son contrôle, laissant un marqueur à l'ancien emplacement. Si un joueur ne peut pas placer le chef à côté de son comté, il doit le déplacer vers l'un de ses comtés contrôlés, sans laisser de marqueur derrière lui. Plus vous avez de marqueurs sur le plateau à la fin de la partie, plus vous gagnez de points !
Pour les chambres, de nombreux postes doivent être occupés afin de gouverner le territoire. Pour chaque région, plusieurs postes doivent être pourvus par les joueurs. Au début de chaque tour, six marqueurs de chambre sont révélés et placés sur les cases correspondantes du tableau de la chambre. Ces six postes sont disponibles pour être pourvus dans chaque région par les joueurs. Celui qui contrôle le plus de comtés dans cette région pourvoira le poste et remplacera le marqueur de chambre sur le tableau par l'un de ses propres marqueurs de joueur. À la fin de la partie, les joueurs reçoivent des points supplémentaires pour les majorités dans les lignes horizontales et verticales du tableau de la chambre.