Des cendres de la guerre, des nations s'élèvent au pouvoir à l'ère atomique. Chaque joueur prend le contrôle d'une nation en lutte pour le pouvoir à la fin du XXe siècle. Il développe l'industrie, le commerce et le gouvernement de son pays en acquérant des ressources, en construisant des structures et en exploitant les sources d'énergie. Le prix du pétrole est en hausse, et l'énergie nucléaire représente l'avenir. The Manhattan Project: Energy Empire se déroule dans le même univers que The Manhattan Project , mais il s'agit d'un jeu indépendant, et non d'une extension.
La principale menace dans l'Empire de l'Énergie n'est pas la guerre, mais les conséquences mondiales incertaines résultant des effets secondaires de l'industrialisation et de la pollution. Nombre d'actions ont un coût. Ainsi, à mesure que les nations deviennent plus industrielles, elles augmentent également la pollution environnementale. Une utilisation prudente de la science peut atténuer les effets néfastes de l'industrie et contribuer à prévenir les crises mondiales.
Energy Empire utilise des mécanismes de placement d'ouvriers, de construction de tableaux et de gestion des ressources. À chaque tour, un joueur peut choisir de travailler ou de générer. Lors d'un tour de travail, un joueur joue un ouvrier sur le plateau principal, puis utilise des ouvriers et de l'énergie pour activer des cartes de son tableau. Les joueurs peuvent dépenser de l'énergie pour utiliser un emplacement occupé du plateau principal, de sorte qu'aucun emplacement n'est jamais complètement bloqué. Lors d'un tour de génération, les joueurs peuvent renouveler leur réserve d'énergie en lançant des « dés d'énergie » représentant le nucléaire, le charbon, le pétrole, le solaire et d'autres formes d'énergie.
